পাকুন্দিয়া উপজেলার আয়তন 180.52 বর্গ কি.মি.।এ উপজেলার উত্তরে কিশোরগঞ্জ সদর ও হোসেনপুর উপজেলা,দক্ষিণে গাজীপুর জেলার কাপাসিয়া ও নরসিংদী জেলার মনোহরদি উপজেলা,পূর্বে কিশোরগঞ্জ জেলার কটিয়াদী,নিকলী ও কিশোরগঞ্জ সদর উপজেলা এবং পশ্চিমে ময়মনসিংহ জেলার গফরগাঁও উপজেলা অবস্থিত।

পাকুন্দিয়া উপজেলা প্রায় 24 ডিগ্রী 16 মিনিট ও 24 ডিগ্রী 24 মিনিট উত্তর অক্ষাংশ এবং 90 ডিগ্রী 46 মিনিট ও 91 ডিগ্রী 45 মিনিট পূর্ব দ্রাঘিমাংশে অবস্থিত। বাংলাদেশ 1982 সালের নভেম্বর মাসে প্রশাসন বিকেন্দ্রীকরণ শুরু হয়। এরই ধারাবাহিকতায় 14 সেপ্টেম্বর 1983 সালে পাকুন্দিয়া থানাকে উপজেলায় উন্নীত করা হয়। তৎকালীন শিক্ষামন্ত্রী ডঃ আব্দুল মজিদ খান পাকুন্দিয়া উপজেলার শুভ উদ্ভোধন করেন।